Если они одинаковые по размеру и формату сжатия то проще всего - virtual dub. После открытия в нем первого файла делать append avi segment для каждого следующего. В меню video и audio постаить direct stream copy и сохранить. Через несколько секунд будет все готово. Но если куски разные, то без перекодирования и потери качества не обойтись. Тогда сначала следует привести два куска к формату лучшего, можно тем же виртуал дабом, и соединить.
