если я правильно понимаю, flac (ape и т.д.) - есть математическая копия оригинала wav. Потому и называются "форматы без потерь". Единственная разница лишь в том, что процессору требуется больше ресурсов, чтоб "на лету" преобразовать математическую копию в оригинальный поток PCM. Как если бы воспроизводить из rar, скажем.