Из своего опыта скажу так: в локальной сети любой организации нужна винда, а вот шлюзы, роутеры, то есть все сетевое оборудование должно быть на Юниксах, Я вообще не юзаю линукс как рабочую станцию, а вот как сервер, linux незаменим, без всяких КДЕ и ГНОМов, только голая консоль, преимущества в том что линукс можно оптимизированно сконфигурить под определенные сетевые задачи, а с виндой так не получиться.